La plupart des cliniciens utilisent les critères de diagnostic de Rotterdam pour diagnostiquer le SOPK (2003). Deux des trois fonctionnalités suivantes sont requises :
- Règles irrégulières (huit saignements menstruels ou moins par an)
- Signes d'augmentation des androgènes dans le sang (par exemple testostérone) ou dans la peau et les cheveux (acné/hirsutisme/chute de cheveux)
- Apparitions d'ovaires polykystiques à l'échographie