多囊性卵巢症候群的診斷與許多其他健康併發症有關，但並非所有患者都會出現每種併發症。健康協會意味著與沒有 PCOS 的患者相比，這些疾病的風險會增加，但每個人的風險不同，只有部分患者會出現這些疾病。與多囊性卵巢症候群專家進行定期臨床照護可以顯著降低未來出現健康併發症的風險。一些常見的健康協會包括：
- 2型糖尿病
- 肥胖
- 心血管疾病
- 代謝功能障礙相關脂肪肝病
- 情緒障礙，包括焦慮和憂鬱
- 受孕困難
